E-кадгерин

Кадгерин 1, тип 1, E-кадгерин (эпителий)
1i7w
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB Список идентификаторов PDB 1O6S, 2O72, 2OMT, 2OMU, 2OMV, 2OMX, 2OMY, 2OMZ, 3FF7, 3FF8, 3L6X, 3L6Y
Идентификаторы
Символ	CDH1 ; Arc-1; CD324; CDHE; ECAD; LCAM; UVO
Внешние ID	OMIM: 192090 MGI: 88354 HomoloGene: 20917 GeneCards: CDH1 Gene
Генная онтология Функция • glycoprotein binding • calcium ion binding • protein binding • beta-catenin binding • protein phosphatase binding • protein domain specific binding • ankyrin binding • GTPase activating protein binding • gamma-catenin binding • cell adhesion molecule binding Компонент клетки • extracellular region • cytoplasm • endosome • trans-Golgi network • plasma membrane • cell-cell adherens junction • focal adhesion • cytoplasmic side of plasma membrane • cell surface • actin cytoskeleton • integral component of membrane • aggresome • basolateral plasma membrane • lateral plasma membrane • catenin complex • cell junction • node of Ranvier • lateral loop • Schmidt-Lanterman incisure • apical junction complex • axon terminus • apical part of cell • perinuclear region of cytoplasm • extracellular vesicular exosome Биологический процесс • trophectodermal cell differentiation • epithelial cell morphogenesis • apoptotic process • cellular component disassembly involved in execution phase of apoptosis • homophilic cell adhesion • synapse assembly • sensory perception of sound • response to toxic substance • single organismal cell-cell adhesion • protein metabolic process • pituitary gland development • negative regulation of cell-cell adhesion • extracellular matrix disassembly • extracellular matrix organization • neuron projection development • regulation of water loss via skin • cell junction assembly • adherens junction organization • response to drug • positive regulation of transcription factor import into nucleus • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cell-cell junction organization • positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of epithelial cell proliferation • regulation of immune response • protein homooligomerization • intestinal epithelial cell development • salivary gland cavitation • regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis • tight junction assembly • cellular response to amino acid stimulus • cellular response to lithium ion • cellular response to indole-3-methanol • protein localization to plasma membrane • establishment of protein localization to plasma membrane • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • cochlea development • regulation of protein localization to cell surface Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	999	12550
Ensembl	ENSG00000039068	ENSMUSG00000000303
UniProt	P12830	P09803
RefSeq (мРНК)	NM_004360	NM_009864
RefSeq (белок)	NP_004351	NP_033994
Локус (UCSC)	Chr 16: 68.77 – 68.87 Mb	Chr 8: 106.6 – 106.67 Mb
Поиск в PubMed	[1]	[2]

E-кадгерин (эпителиальный кадгерин; кадгерин-1, 1-го типа; CDH1, CD324) — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства кадгеринов, продукт гена CDH1. Ген был впервые клонирован в 1987 году.

Функции

E-кадгерин вместе с N- и P-кадгеринами относится к 1-му типу кадгеринов, кальций-зависимым белкам клеточной адгезии. Они вовлечены в гомофильные взаимодействия, образуя межклеточные контакты.

E-кадгерин вовлечён в механизмы регулировки межклеточной адгезии, клеточной подвижности и пролиферации эпителиальных клеток. Имеет потенциальную супрессорную роль в клеточной инвазивности. Является лигандом для интегринового рецептора альфа-E/бета-7.

Домен E-кадгерина CTF2 стимулируют неамилоидную деградацию предшественника амилоида-бета (APP) и ингибирует образование продуктов C99 и C83.

Структура

E-кадгерин состоит из 728 аминокислот (после созревания), молекулярная масса белковой части — 97,5 кДа. Основной N-концевой участок (555 аминокислот) является внеклеточным, далее расположен единственный трансмембранный фрагмент и внутриклеточный фрагмент (152 аминокислота). Внеклеточный фрагмент включает 5 повторов кадгеринового домена и 4 участка N-гликозилирования. Цитозольный фрагмент содержит 3 участка фосфорилирования (по сериновому остатку).

Белок содержит 3 позиции, которые могут гидролизоваться под действием протеаз и образовывать активные фрагменты. Позиция 700-701 гидролизуется металлопротеазой с образованием фрагмента водного CTF1. Позиция 731-732 расщепляется гамма-секретазой/PS1 с образованием фрагмента CTF2. Связь 750-751 гидролизуется каспазой-3 с образованием CTF3.

Патология

Нарушения гена коррелируют с развитием карцином желудка, молочной железы, толстой кишки, вилочковой железы и яичников.

См.также

• Кадгерины
• Кластер дифференцировки

Библиография

• Becker S.F., Langhe R., Huang C., Wedlich D., Kashef J. Giving the right tug for migration: Cadherins in tissue movements (англ.) // Archives of Biochemistry and Biophysics : journal. — Elsevier, 2012. — March. — DOI:10.1016/j.abb.2012.02.013. — PMID 22387375.
• Brigidi G.S., Bamji S.X. Cadherin-catenin adhesion complexes at the synapse (неопр.) // Curr. Opin. Neurobiol.. — 2011. — April (т. 21, № 2). — С. 208—214. — DOI:10.1016/j.conb.2010.12.004. — PMID 21255999.
• Grabowska M.M., Day M.L. Soluble E-cadherin: more than a symptom of disease (англ.) // Frontiers in Bioscience : journal. — Frontiers in Bioscience, 2012. — Vol. 17. — P. 1948—1964. — PMID 22201848.
• Buda A., Pignatelli M. E-cadherin and the cytoskeletal network in colorectal cancer development and metastasis (англ.) // Cell Commun. Adhes. : journal. — 2011. — December (vol. 18, no. 6). — P. 133—143. — DOI:10.3109/15419061.2011.636465. — PMID 22176698.